据材料“袁世凯以全权组织临时共和政府”和“共和政府不能由清帝委任组织”可知双方争论的是由谁组建政府，即政府组建的主导权，故选B项；据材料可知双方都强调共和制度，排除A项；材料提及共和政府的组织属于政治革命，不是社会革命，社会革命是实现平均地权，排除 C项；材料强调的是共和政府的主导权，据所学孙中山同意只要袁世凯赞同共和，中华民国政府的总统就让位给袁世凯，排除D项。