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根据所学知识可知，孙中山为了争取民族独立领导了辛亥革命，推翻了清政府的封建统治，建立了中华民国，甘地领导了印度的非暴力不合作运动，沉重打击了英国的殖民统治，都领导本国人民争取民族独立，故选D项；汤显祖是中国明朝时期著名的戏曲家，没有反对教会的“神权至上”，排除A项；宋应星是中国明朝时期著名的科学家，著有《天工开物》，但不是近代自然科学的奠基人，牛顿是近代自然科学的奠基人，排除B项；洪秀全领导了太平天国运动，沉重打击了清政府的封建统治，林肯领导了美国南北战争，废除了奴隶制度，排除C项。