C

根据所学知识可知，明太祖即位后，改革行政机构，加强君权，在中央废除丞相，权分六部，六部直接对皇帝负责；在地方，废除行中书省，设立三司，因此在改革后得以保留的是六部，故选C项；行中书省在改革后被废除，排除A项；厂卫是明太祖时设立的锦衣卫和明成祖时设置的东厂的合称，与题干“得以保留”不符，排除B项；丞相改革后被废除，排除D项。