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【解析】据材料“中有一二权势稍重者皆上窃君上之威灵，下侵六曹之职掌，终以取祸。”可知阁臣权势过重，据所学内阁为皇帝私属辅政团队，阁臣权势过重实质反映皇权加强，故选B项；据材料“只备论思顾问之职，原非宰相”，排除A项；六部为国家法定行政机构，内阁为辅政机构，互不统属，均对皇帝负责，排除C项；中央集权反映国家对地方的管理加强，非中枢权力运行问题，排除D项。