D

根据材料“距今5800年前后，黄河、长江中下游以及西辽河等区域出现了文明起源迹象；距今5300年以来，中华大地各地区陆续进入了文明阶段；距今3800年前后，中原地区形成了更为成熟的文明形态，并向四方辐射文化影响力，成为中华文明总进程的核心与引领者”可知，距今5000千多年到3800年前后，我国黄河、长江以及辽河流域出现了文明起源的迹象，而且成为中华文明总进程的核心与引领者。由此可知，中华文明探源工程延伸了中华文明史的轴线，故D项正确；
仅从材料信息无法得出“开创了历史研究的中国模式”，而且材料也没有涉及历史研究的中国模式，故A项错误；
材料没有比较中华文明与其他文明，无法得出“领先世界”的结论，故B项错误；
20世纪三四十年代，考古学才成为一门新兴学科，故C项错误。