C

题干中教皇乌尔班五世允许牛津大学自主选举校长，削弱了教会对大学的直接控制，使大学获得更多学术自主权，14世纪正值文艺复兴初期，人文主义思想开始兴起，强调人的理性和自主性，大学脱离教会干预更利于自由探索人文知识，推动思想解放，故选C项；教权与王权博弈通常表现为双方权力争夺，如主教授职权斗争，而材料是教皇主动放权，未涉及王权参与，排除A项；宗教改革始于16世纪马丁·路德行动，与1368年时间不符，排除B项；近代科学兴起以16世纪哥白尼、17世纪牛顿等为代表，与题干时间及大学管理权变化无直接关联，排除D项。