D

据所学知识，水稻发源于长江流域，故①错误；据材料“其‘宫城’东西宽约55米、南北长约67米，各处地面、墙壁都以石灰多层涂抹。遗址内有5千米以上的沟壕，还出土了白陶、黑陶、绿松石珠等贵重物品，以及大量炭化水稻遗存”可知，此时出现了宫城和大型建筑以及贵重物品等，说明出现了公共权力，产生了国家的初始形态，反映了早期国家社会的发展，故②正确；据所学，秦朝建立了我国历史上第一个专制王朝，故③错误；材料中的甘肃庆阳南佐遗址也是中华文明的组成部分，反映了中华文明的多元一体的特点，故④正确；选择D项符合题意。