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结合所学知识可知，总理衙门是第二次鸦片战争后清政府设立的处理与洋人相关事宜的外交机构，它的设立，是晚清外交走向近代化的重要一步，但是结合材料“总理衙门只不过是李鸿章大学士在天津衙门的一个分支机关”可知，总理衙门虽然是清政府设立的外交机构，但是实际上听命于李鸿章的天津衙门，因此这体现了晚清外交转型曲折，D项正确；
材料不能体现清朝固守天朝上国理念，结合史实来看，鸦片战争后，清朝有识之士开始意识到西方的强大，排除A项；
材料没有体现总理衙门权力大小问题，排除B项；
材料体现的是近代中国外交转型遇到挫折，不是强调北洋大臣与中央分庭抗礼，排除C项。