根据题干在道光咸丰之际，出现了绅董阶层，绅董积极介入地方事务，有地方推举或选举，形成“事由局而不由县，权在绅而不在官”的局面，体现了在晚清时期的基层自治情况，推动了基层社会治理，D项正确；根据“事由局而不由县，权在绅而不在官”可知地方政府在基层社会治理中作用降低，排除A项；根据题干绅董在地方治理中起到一定的作用，但其属于基层自治的内容，并未中央权力下移，威胁中央集权的因素，排除B项；题干中绅董是基层自治，并非官僚机构，不能体现社会阶层的流动，排除C项。故选D项。