D

根据材料“在日耳曼人入侵时，由于罗马帝国本身岌岌可危，无力保护城市，在这种情况下，贵族们纷纷迁入自己的乡村别墅，让庄客、士兵、佃农和奴隶居住四周，形成狭小而坚固的军事堡垒。这种应急的社会组织形式被固定下来，形成了罗马帝国结束以后西欧社会的基本单元”及所学可知，应急的社会组织形式被固定下来，形成了罗马帝国结束以后西欧社会的基本单元。在这种社会单元中，贵族作为领主控制着土地（乡村别墅及其周边土地），士兵可以视为领主的武装力量，佃农和奴隶则为领主耕种土地等，这与采邑制庄园经济中领主、封臣、农奴的关系相符。由此可见，这种社会单元的广泛出现为采邑制庄园经济的形成奠定了基础，D项正确；
这种社会组织形式固定下来后，逐渐发展成为封建庄园的雏形。在封建庄园里，贵族领主对土地有控制权，对庄客（农奴等）有一定的管理权力，这是封建制度下领主与农奴关系的体现，但据此并不能直接得出欧洲从奴隶制社会向封建社会的整体转变，排除A项；
这种由军事堡垒发展而来的社会单元，主要是一种基于经济（土地）和军事防御的社会组织形式，与基督教在西欧统治地位的确立并没有直接的因果关系，排除B项；
这种社会单元更多的是与当地的罗马文化和日耳曼文化等相互影响、融合的过程，与欧洲东西方文化的融合关系不大，排除C项。
故选：D。
本题考查了西欧封建社会庄园及封君封臣制度，要求学生阅读史料并结合所学作出回答。
本题要求学生具有解读材料信息，调动和运用知识分析历史问题的能力。