古代雅典的最高司法机构是陪审法庭，不是公民大会，故A项错误；古代雅典公民大会是最高权力机关，材料中就是公民大会决定了判处死刑，所以公民大会具有至上权威，故B项正确；材料只是提及公民大会的独断，不听取个人申辩，并不是被告人没有申辩的权利，故C项错误；材料主要是讲述公民大会将被指控救援不力的6位将军判处死刑，但是将军并不能代表军队，也不能就此说军队与公民大会之间存在冲突，故D项错误。