据材料“学者不当自为之”，可得出抑商观念仍然存在，农本思想没有被否定，故A项错误；据材料“学者不当自为之”，可得出抑商观念仍然存在，重商主义并未盛行，故B项错误；据材料“学者不当自为之”，可得出传统重义轻利的观念仍然存在，没有废弛，故C项错误；据材料“商亦无害”，可得出传统抑商观念有所削弱，故D项正确。