B

 题干中“纹章下半部都是互相交叉的肉桂，周围是3个肉豆蔻和12朵丁香花等香料植物图案”并结合所学知识可知新航路开辟的根本原因是资本主义萌芽的产生，故选B项；导致西欧市场金银贬值是大量黄金、白银涌入西欧，排除A项；肉桂、肉豆蔻、丁香花等香料植物来自亚洲，且一个徽章无法反映出物流频繁交流，排除C项；“物竞天择”进化理论产生于300年多后的1859年，排除D项。