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将青海地区划分为不同的行政区和族群，并分别设立管理机构和官员来管理。通过细分区域和族群，朝廷可以更有效地控制青海地区，防止地方势力过于强大，从而威胁到中央的统治。这种划分和分别治理的做法正是“分而治之”的体现，故选C项；“将青海划分为29个族，每族设一名头目”体现了因俗而治，但材料中康熙、雍正时期的措施没有体现对青海少数民族风俗的尊重，排除A项；“修教”，即重视教育，通过教育来培养民众的品德和能力，提升社会的整体素质，然而，在康雍乾时期朝廷治理青海的三项措施中，我们并没有看到与“修教”相关的内容，排除B项；民族自治意味着地方民族或族群在其区域内拥有相对独立的治理权，相反，这些措施更多地强调了中央对青海的控制和任命权，排除D项。