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据材料“营建‘历代帝王庙’祭祀历史上18位重要的开国君主。清朝的历代帝王庙享祀帝王达到188位，包括了中国历史上几乎所有王朝的绝大多数帝王，并以历代名臣、功臣从祠”可知，明清时期祭祀历代帝王彰显了政权更迭、主权延续的特点，体现了中华民族一体多元的统治秩序一脉相承，有利于整合民族国家认同，故选C项；明清时期通过设立内阁、军机处等中枢权力机构强化君主专制统治，排除A项；南宋以后理学的正统地位逐渐确立，因此对五帝、三王、唐、宋创业之君等历代帝王进行祭祀与理学无关，更能体现对中华文化遗产的继承，排除B项；明清时期皇帝对历代圣君及各族名臣进行祭祀，体现了对统一多民族国家的认同，总结历代治国经验应该以史为鉴进行学习，排除D项。