B

根据题干内容可知，在清朝所编纂的《贰臣传》中，其人物身份是“曾经为清朝立下汗马功劳的明朝降臣”，并把“史可法等当初誓死抵抗清军的前明官员列为忠臣”，说明乾隆皇帝寻求儒家价值观念的认同，达到思想的统一，进而维护其专制统治，故选B项；将明朝降臣编入《清史列传》中，从表面来看能够体现乾隆皇帝重新评价他们的历史贡献，但是这不是其根本目的，排除A项；在题干内容中仅是述及了“曾经为清朝立下汗马功劳的明朝降臣”、“誓死抵抗清军的前明官员”这两类人物，并没有涉及其他，不能据此扩大为“为本朝修史确立新的指导思想”，排除C项；根据所学知识可知，自南宋以后，程朱理学逐渐发展成为官方哲学，其正统地位并没有受到冲击，排除D项。