根据材料“当时它却没有形成强大的扫荡旧经济基础的革命性变化”，可知明清时期虽然商品经济和对外贸易相对繁荣，但是由于重农抑商、海禁和闭关锁国政策的影响，导致小农经济依然占据主导地位，故选B项；商品经济的发展受地理环境的影响，但是不占据主导地位，排除A项；鸦片大量流入是在1840年鸦片战争之后，排除C项；工业革命开始于18世纪60年代，处于清朝中后期，排除D项。