C

据材料“部分台湾人士……得出‘大陆欺负台湾’的论断”可知，部分台湾人士只看到台湾地方官多为大陆人，没有看到台湾人也可以到大陆为官，说明他们缺乏全局眼光，故选C项；材料主要强调大陆人任台湾地方官是因为地方官本籍回避制度，不是强调清政府加强对台湾的控制，排除A项；材料只涉及地方官本籍回避制度，不是清朝疆域问题，排除B项；材料中部分台湾人士没有从全局的眼光研究台湾地方史，但材料没有涉及这些人士的政治立场，不能得出政治立场影响史学研究方法的选择，排除D项。