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据材料“日心说”并结合所学可知，16—17世纪，欧洲的自然科学研究取得重大突破，近代科学兴起，被称为“科学革命”，波兰天文学家哥白尼提出“日心说”，否定天主教会宣扬的“地心说”，建立起一种新的宇宙观，结合所学可知，近代科学的兴起在当时是因为文艺复兴和宗教改革的深入发展，故选D项；“日心说”的提出是近代自然科学兴起的表现，并非原因，排除A项；理性主义是启蒙运动的核心思想，近代自然科学兴起的时候启蒙运动尚未开始，时间上与材料不符，排除B项；“日心说”的提出否定天主教会宣扬的“地心说”，教会统治地位有所动摇，但这是其影响，并非原因，排除C项。