D

旅顺大屠杀发生于1895年而非1942年前后，故A项错误；南京大屠杀并没有使用细菌弹，故B项错误；潘家峪大屠杀发生于1941年，但同样没有使用细菌弹，故C项错误；“七三一部队”是侵华日军在东北区地的生化武器研究中心，细菌弹是一个非常重要的研究项目，其负责人正是石井四郎，故D项正确。