C

明朝在洪武十三年（1380年），明太祖朱元璋废除丞相制度，权分六部，并设立五军都督府等机构，皇帝直接总揽大权，材料中“罢丞相，设五府、六部”正与此史实吻合，故选C项；秦朝实行三公九卿制，丞相作为重要官职始终存在，未被废除，且无五府六部之设，排除A项；汉朝承袭秦制，设有丞相职务，后来虽设大司马等但丞相未罢黜，排除B项；清朝沿袭明制，但丞相在明朝已废，清朝设立军机处等机构，无“罢丞相”之举，排除D项。