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 元朝在西南少数民族地区实行土司制度，“以土官治土民”，有利于巩固统一多民族的国家，故选B项；宋代设立枢密院管军事，长官为枢密使，分割宰相军权，排除A项；元朝确定行省以下的行政区划依次为路、府、州、县，排除C项；元朝时管辖西藏和四川、青海部分地区的机构是宣政院，清朝专设理藩院掌管蒙古族、藏族等民族事务，排除D项。