B

 从材料中“国会……先后出台了《紧急银行法》、《农业调整法》、《国家工业复兴法》等法案，以立法的形式授予总统紧急权力”可以看出，国会通过立法扩大了联邦政府与总统的权力。因此，B选项符合题意。
其它选项：A选项，从材料中“国会与总统高度配合，先后出台了……等法案”及“美国政府通过国会新的立法……”等可以看出，罗斯福新政并没有违背三权分立的原则；C选项，罗斯福新政的根本目的是巩固资本主义制度，而经济危机是由资本主义制度的基本矛盾导致的，因此，罗斯福新政不可能从根本上消除经济危机；D选项，罗斯福新政的性质是一场资产阶级改革，是资本主义的一次自我完善，因此，不是削弱而是巩固了美国的民主共和制。以上均不符合题意。故本题答案为B。