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分析题干材料中的“军爵制度打开了让孔武之人进入统治阶层的通道”可知，商鞅变法奖励军功，对有军功者授予爵位，这打开了孔武之人进入统治阶层的通道，促进了社会阶层流动；分析题干材料中的“又发明出科举制度，为底层的知识分子打通了另外一个通道”可知，科举制以考试方式不拘一格选拔人才，让底层的知识分子可以通过科举选拔进入统治阶层，也促进了社会阶层流动。所以材料意在说明军爵制和科举制都促进了社会阶层流动，故选D项；商鞅奖励军功的确提高了秦国军队的战斗力，但材料主旨并非这一影响，而是奖励军功对社会阶层流动的促进作用，排除A项；材料只是说军爵制和科举制打开了孔武之人和底层知识分子进入统治阶层的通道，无法说明他们的仕途从此顺畅，排除B项；科举制选拔人才包括底层的知识分子，的确扩大了选官范围，但选项C无法涵盖军爵制的影响，排除C项。