A

 根据材料“文艺复兴和宗教改革共同具有思想解放的性质，然而两者要实现的目标却有所差别。文艺复兴的目的在于走出中世纪，走向现代文明；宗教改革则是上层建筑领域的一场变革，目的在于开创现代意义上的民族国家”我们不难得知，在由中世纪向近代社会的转型过程中存在着明显的阶段性特征，故A项正确；材料中并没有论及文艺复兴和宗教改革二者之间的关系，故B项错误；材料中同样没有对文艺复兴和宗教改革局限性的相关提及，故C项错误；无论是宗教改革还是文艺复兴，二者发生作用的领域都是意识形态和上层建筑领域，故D项错误。