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 元代在福建晋江设置澎湖巡检司，履行行政管理职能，以经略台湾，故选B项；元代设置宣慰司，以加强对西域的管理，排除A项；吐蕃地区由直属中央的宣政院进行管理，排除C项；元代管理东北地区的是辽阳行省，排除D项。