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A.在达?伽马开辟到达印度的新航路之前，阿拉伯人控制着印度洋上的贸易，因此达?伽马船队与阿拉伯人的冲突实质是新航路对旧航路构成的挑战，正确；
B.当时达?伽马并未开始对非洲进行殖民统治，排除；
C.当时处于新航路开辟的初期，世界尚未连为一体，“争夺世界经济中心”不符合题意，排除；
D.达?伽马与阿拉伯人都主要通过海上商路开展贸易，排除。
故选：A。
本题侧重于考查新航路的开辟，解题关键信息是“1498年2月，达?伽马到达非洲东海岸莫桑比克港。据船队记载，该港有许多阿拉伯人在此经商，并对船队很友好，但获知其来历后，表现出明显的敌视，并拒绝再供应淡水和食物。达?伽马用炮轰击阿拉伯人，并抢夺其船只离去”。
本题侧重于考查新航路的开辟，答题关键在于对材料的分析和相关知识点的把握。