A

清政府设立军事学堂和派遣留学生学习军事的举措，在提高军队知识化程度的同时，还使新思想在军队中迅速传播，这些新思想包括了对清政府统治的质疑和反抗，部分新军接受了革命思想，又进一步推动了新的革命浪潮的到来，故选A项；学堂选官制是在1904年才实行，与题干时间不符，排除B项；1901年是在甲午中日战争后，当时洋务运动已经失败，C项与史实不符，排除C项；我国军事近代化改革开始于洋务运动时期，与题干时间不符，排除D项。