【答案】D

【解析】由材料“采取一系列措施打击基督教，在处理教案时对教会也持强硬态度”、“清政府却删除一些禁教规定，处理教案时更多的是偏袒教会”可知第二次鸦片战争时期，清政府为了镇压农民起义，与列强勾结，遂更多的偏袒教会，说明这一时期国内政治局势的复杂变化，故选D项；《辛丑条约》签订后，清政府成为列强侵华的工具，排除A项；第二次鸦片战争时期中国社会的主要矛盾是阶级矛盾，排除B项；“瓦解”表述不符合史实，且近代外交体制的形成是一个缓慢的发展的过程，排除C项。