D

根据材料可知虽然1861年“清廷改设总理各国事务衙门总揽外交事务。但君臣朝野视之为不祥之物”任职于总理衙门的人始终无法立年表。这说明中国近代外交转型过程中还存在着思想观念陈旧等问题，故D正确。本题并未重点强调官僚等级秩序问题，故A错误。总理各国事务衙门的建立标志着近代中国外交的开始，但非本题主旨内容，故B错误。本题信息与宗藩外交体系无关，故C错误。