C

据材料“其中乾隆年间修建的均位于将军、都统、参赞大臣等本地军政首脑所驻城内或城郭附近”可知万寿宫是国家政权的象征，兴建万寿宫主要是出于政治目的，统一新疆后，强化其对政权认同，C项正确；
民族交融是客观上所起到的作用，排除A项；
仅从材料，体现的是对政权的认同，并不是抵御列强侵略，排除B项；
万寿宫的兴建是强化政权的认同，并不是处理政务的场所，并不能提高行政效率，排除D项。