B

据材料“明清时期，甘青宁地区文庙的兴建迎来一个高潮”可知，明清时期甘肃、青海、宁夏等地在中央政府的统治之下，政府重视文庙的建设有助于在当地宣扬儒家思想，并且推动汉文化的传播，这体现了明清政府在统治中重视边疆地区的文化治理，故选B项；儒学在汉代开始被确立为正统思想，在中国的影响逐步扩大，在边疆地区的影响不可能在明清时期才开始，“开始”说法错误，排除A项；边疆和内地一体化治理从元朝就开始了，且材料强调文化措施，并未体现税收、基层治理等政治、经济措施，不能得出“一体化治理格局形成”，排除C项；材料仅体现了文庙的修建，这有助于加强对儒家伦理的认同，但不代表其认同国家，且“意识强烈”无从体现，排除D项。