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由“设立专门管理机构、修驿路、建船厂、派员巡视”可得，这是明朝对奴儿干都司地区的行政管理方式，而“更命造寺，使柔化之”、“永乐年间，朝廷兴建永宁寺”、“立有《敕建永宁寺记》石碑，用汉、蒙、女真、西藏文体书写”则体现出政府更强调对当地百姓用宗教进行教化的措施，所以题干信息体现出明朝政府对当地的措施具有“政教兼举，教化为先”思想，故选A项；题干所述更强调教化的作用，而“外儒内法，儒法兼施”思想更注重的是政治控制措施，这与题目主旨不符，排除B项；“制国有常，利民为本”思想强调的是按照常规方法，实现民本思想，而题干所述措施主要目的是对当地民众的政治控制，而不是以民为本，排除C项；题干所述措施具有一定的因俗而治特征，但是并未体现出“以夷制夷”，因为其所述多为汉族地区所采取的措施，排除D项。