B

 从明清的小说中“以商贾为第一等生，科第反在次者”，反映了由于商业的发展使社会对传统的士农工商的传统观念发生了变化，故选B项；重农抑商政策自商鞅变法以来一直到清末都在推行，排除A项；传统的士农工商四民整体上仍然存在，排除C项；明清时期政府一直重视科举，排除D项。