D

依所学，重农抑商不是禁止商业活动，而是抑制商业活动的开展，故A项错误；依所学，三省六部制下，相权三分强化了皇权，故B项错误；依所学，行省境内重大民政事务需要向朝廷奏报，故C项错误；依所学，内阁始终不是法定的中央一级的行政机构，权力来自皇帝的信任与支持，故D项正确。