C

据材料信息并结合所学可知，在殖民者入侵之前，玛雅文明的确在尤卡坦半岛的石灰岩地区繁荣发展。他们的工具主要包括石器、木器和骨器，这些工具虽然看似原始，但在玛雅人的手中却发挥了巨大的作用。他们利用这些工具，在热带雨林中开垦土地，发展出了高效的农业系统；玛雅人的农业管理技术较先进，他们采用了多种农业技术，如梯田、灌溉和水井，使得农业生产效率大大提高。此外，他们还使用了轮作和肥料等先进的农业管理方法，使得土地能够持续产出丰富的农作物，故选C项；“工具技术的改进”与材料中“他们的工具主要是石器、木器和骨器”相矛盾，排除A项；优越的地理条件是粮食产量高的条件之一，没有农民的辛勤耕作与管理，粮食产量依然不高，排除B项；据所学可知，在西方殖民者入侵美洲之前，古代美洲与外部交流少，D项表述不符史实，排除D项。