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由材料“葡萄牙人抵达东方，他们主要通过占据据点，与他人交易来赚钱：而西班牙人、英国人和法国人则通过大规模占领他国领土，对其进行野蛮的殖民掠夺”可知葡萄牙通过建立贸易站进行商业殖民，而西班牙、英国、法国通过强大的海军力量、国家经济实力直接占领殖民地，这一差别源自于国家整体实力的差别，故选D项；殖民的目的都是掠夺财富，排除A项；经济发展水平是国家整体实力的具体体现，D选项内涵外延包含了B选项，排除B项；殖民地都进行了激烈的反抗，排除C项。