B

据材料信息结合所学可知，明朝对汉族聚居区、汉族与边地民族聚居区交界地带以及更边远的边疆民族聚居区采取了不同的管理措施，这充分体现了明朝在边疆政策上的灵活性和务实性，故选B项；虽然明朝对不同的民族聚居地区都进行了管理，但管理措施并不统一，而是根据具体情况灵活调整，排除A项；材料涉及到在更边远一些的边疆民族聚居区以土司和羁縻卫所为框架，未提及改土归流，大规模改土归流开始于清朝前期，排除C项；明朝都司卫所是军事机构，不受地方政府的管理和控制，排除D项。