A

据材料“有良知的基督徒可以放弃对国家的忠诚...秩序的革命责任”这一思想强调了宗教与世俗权力的分离，为资产阶级革命提供了宗教上的支持，有助于资产阶级革命的开展，故选A项；近代自然科学的发展主要是建立在实验和观察的基础上，与马丁·路德等人的宗教改革思想没有直接关联，排除B项；宗教改革16世纪，德意志的统一在19世纪，两者不直接相关，排除C项；马丁·路德等人的宗教改革思想旨在改革教会，而非彻底摆脱宗教信仰，排除D项。