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根据“在7-9世纪的拜占庭帝国，随着斯拉夫人、阿拉伯人在境内大量定居，斯拉夫人习惯法、罗马一拜占庭法以及伊斯兰教法相互影响，出现了《农业法》《海商法》等一批新法律”可得出随着不同族群的增多，拜占庭帝国融合了各地区的法律，制定了新的相关的法律，有利于维护帝国的统治，提高了国家治理水平，D项正确；
拜占庭帝国并不实行庄园自治，排除A项；
这些法律是万民法，而不是市民法，排除B项；
《罗马民法大全》6世纪已经颁布，排除C项。
故选：D。
本题考查了拜占庭帝国的兴衰与俄罗斯的扩张，要求学生阅读史料并结合所学作出回答。
本题考查了拜占庭帝国的兴衰与俄罗斯的扩张，要求学生具有解读材料信息，调动和运用知识分析历史问题的能力。