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清廷在近边地区划定蒙古诸部的游牧区域，实际上是对这些地区行使主权的一种表现。通过划定区域，清廷明确了其对蒙古诸部的管辖和统治，这反映了清廷主权意识的萌芽，故选D项；游牧区域的划定（“定牧”）体现的是“因俗而治”，而非“边疆与内地的一体化”，A项说法错误，排除A项；虽然划定游牧区域可能有助于边疆的稳定，但“确保了”这一表述过于绝对。边疆地区的稳定受多种因素影响，包括政治、经济、文化等，不能单纯由游牧区域的划定来确保，排除B项；农耕文明主要依赖于土地和水利等条件，而蒙古诸部的定居化并不直接推动农耕文明的扩展，排除C项。