B

结合所学知识，明清之际，商品经济的发展、君主专制的加强、理学的僵化和束缚使得先进的知识分子对原有的理学经典和传统进行了挑战，A项表述属于表现，并非原因，故A项错误；根据前面的分析，故B项正确；理学对人们思想的束缚并非主要原因，故C项错误；结合所学知识，政府的抑商政策并未出现松动，故D项错误。