B

据材料“当在乎致知，致知当在乎格物”“以‘明理’为首篇”可知，明代医家著作中主张“格物致知”和“明理”，这反映出理学影响医家治学理念，故选B项；材料内容强调的是明代医家的治学理念，没有关于对医学的进行批判的描述，不能得出“医学在批判中发展”的结论，排除A项；虽然明代医家努力追求学问，但材料语境并未显示出“社会崇医之风盛行”，此项与材料主旨不符，排除C项；明代医家强调“格物致知”和“明理”，这不是教条主义的表现，不能得出“明代医学陷入教条困境”的结论，排除D项。