B

根据材料“共28卷，包括科学、神学、哲学等”，可知《百科全书》涵盖面广，不仅涉及人文学科，还包括自然科学，体现了人文精神和科学思维相结合，B项正确；
材料信息看不出启蒙运动具有广泛的社会基础，排除A项；
材料只提到《百科全书》的内容，未涉及民众的态度，排除C项；
《百科全书》属于综合性书籍，无法说明科学技术与思想的关系，排除D项。