B

据题干“旅顺失矣，盛京危矣”可知，美国传教士林乐知提及的战争为甲午中日战争，排除A项；据所学知识可知，甲午中日战争失败后，台湾被割让给日本，但不愿做亡国奴的台湾军民对日本侵略进行了顽强的抵抗，故选择B项；据所学知识可知，“东南互保”发生在八国联军侵华期间，与材料时间不符，排除C项；据题干可知，面临“旅顺失矣，盛京危矣”的民族危机时，“各省大吏，唯知自顾封疆”，尚不如“古者列国分封，当王室多事之秋，犹有勤王之义旅”，所以他认为导致战争失败的主要原因是各省长官没有积极拱卫中央，体现出清朝中央集权弱化，而不是战争导致了中央集权弱化，故排除D项。