B

民国初年，北洋军阀割据混战，中央权威丧失，各省军阀拥兵自重，截留税款、自征赋税，导致中央政令不出省界；地方上，军阀依靠土豪劣绅控制基层，造成治安废弛、徭役摊派无度，民众流离失所，这直接反映了军阀割据对地方治理的严重破坏，故选B项；地方自治是近代民主治理形式，材料中各省自征赋税、基层被土豪把持并非有效推行地方自治，排除A项；传统治理体系是中央集权下的官僚体系，此时只是中央权威受军阀削弱，并非完全失效，排除C项；基层治理虽混乱，但材料未提及战乱直接冲击基层体系，排除D项。