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据宫城局部示意图的左侧下方可见军机处，可知是清朝皇帝雍正时设置。明太祖时还没有设南书房和军机处，故A项错误；明成祖时也没有设南书房和军机处，故B项错误；康熙帝时设南书房，没有军机处，故C项错误；据所学雍正时设有南书房和军机处，故D项正确。